Colter Stevens katona, aki egy új kormányprogramban, a Source Code-ban vesz részt. A program arra az elméletre épül, ami lehetővé teszi az időbeli és térbeli utazást, sőt azt is, hogy az ember átvegye az irányítást egy másik test felett, anélkül, hogy bármilyen maradandó hatást váltana ki az utazó a jelenre. Colter egy vonaton ébred, egy idegen testben, hamar rájön, hogy ez már a kísérlet része. Nyolc perc van hátra az életéből, mert a vonaton egy bomba ketyeg. A katona feladata az, hogy rájöjjön, hogyan hatástalaníthatja a bombát. Szerencsére erre több esélye is van, hiszen képes utazni az időben.